Una cepa que produce biomoléculas antimicrobianas y antiinflamatorias (principalmente 1,4-Diaza-2,5-dioxobiciclo[4.3.0]nonanos y derivados de pirazina) fue evaluada por su capacidad para curar la endometritis clínica en búfalos en comparación con el tratamiento convencional basado en antibióticos. Los búfalos diagnosticados con endometritis clínica (n = 16/grupo) fueron infundidos intrauterinamente con cuatro dosis de 10 CFU libres (grupo FLC) o nanoencapsulados (grupo NLC) y se compararon con aquellos que recibieron tres dosis de solución salina + una dosis única de 500 mg de cephapirin benzatina (grupo AB) o cuatro dosis de solución salina (grupo control, C) cada dos días. Se analizaron muestras de endometrio para la expresión citológica (células polimorfonucleares, PMN), bacteriológica y de ARNm proinflamatorio. Se recolectaron muestras de lavado uterino y sangre para determinar las concentraciones de citoquinas proinflamatorias y metabolitos en las muestras de sangre. Se evaluó el rendimiento reproductivo de los búfalos. En comparación con el grupo C, los grupos AB y NLC tuvieron el porcentaje más bajo de PMN, seguidos por los del grupo FLC (< 0.05). Todos los búfalos tratados tuvieron significativamente menos patógenos que los búfalos de control. En comparación con el control, todos los tratamientos redujeron significativamente la expresión de ARNm que codifica proinflamatorios en el endometrio. Las concentraciones de actividad de estearasa de leucocitos en los lavados uterinos se redujeron significativamente en los grupos AB y NLC en comparación con los grupos C y FLC. Todos los tratamientos disminuyeron significativamente las concentraciones de citoquinas proinflamatorias en suero en comparación con el control. Tanto los grupos AB como NLC tuvieron concentraciones de NEFA en suero significativamente más bajas que los grupos C y FLC. El porcentaje de búfalos de control con un útero ecogénico y un puntaje de PVD > 2 fue significativamente mayor que el de los búfalos tratados, con un mayor número de cuerpos lúteos, tasas de concepción más altas y menos días abiertos que los búfalos de control (< 0.05). En conclusión, los metabolitos antimicrobianos y antiinflamatorios producidos reducen las respuestas inflamatorias uterinas y mejoran la fertilidad en búfalos.