Se realizó un experimento en invernadero para estudiar los efectos del nivel de concentración de oxígeno en la zona de raíces y del injerto en la fluorescencia de la clorofila, la fotosíntesis y el crecimiento del tomate cherry cultivado en un sistema hidropónico. Dos concentraciones de oxígeno en la zona de raíces, a saber, Ox (nivel de saturación) y Ox- (2-3 mg L), se aplicaron durante 30 días en tomate cherry autoinjertado o injertado en los híbridos , , y . La hipoxia de la raíz aumentó la fluorescencia mínima (en un 10%) mientras disminuyó la fluorescencia variable y el rendimiento cuántico máximo de PSII (hasta un 16 y 8%, respectivamente). Además, redujo la fotosíntesis de la hoja, la transpiración y la conductancia estomática (en un 12, 17 y 13%, respectivamente), mientras aumentó la fuga de electrolitos de la hoja (en un 2.1%). Las combinaciones de injertos mostraron una capacidad diferente para amortiguar los efectos de la hipoxia de la raíz en el crecimiento de la planta y los componentes relacionados, y estas diferencias estaban relacionadas con su biomasa de raíces. La fluorescencia mínima se correlacionó negativamente con el crecimiento de la planta, por lo que puede ser un indicador útil para seleccionar portainjertos tolerantes a la hipoxia de la raíz. Nuestros resultados sugieren la presencia de restricciones difusivas y metabólicas a la fotosíntesis del tomate bajo hipoxia de la raíz, una condición que puede ser mitigada seleccionando portainjertos con un sistema de raíces más desarrollado.