La relevancia de la coccidiosis, una enfermedad parasitaria de las gallinas, en los sistemas de producción avícola familiar (SPAF) fue evaluada en Buenos Aires, Argentina, y Santiago, Chile, mediante el análisis de muestras obtenidas de gallineros en el laboratorio y a través de una encuesta dirigida a los productores. Encontramos que la coccidiosis es una enfermedad prevalente en los SPAF, diseminando especies parasitarias de estos coccidios en el ambiente. También estimamos un bajo nivel de conocimiento sobre la coccidiosis y su asociación con otras enfermedades, así como una falta de estrategias de prevención para evitar brotes entre los productores familiares. Este estudio descriptivo es el primero realizado en los SPAF en esta región. Sus hallazgos pueden ayudar a la introducción de mejoras sanitarias para atenuar la diseminación del parásito y mejorar la salud de las gallinas, así como contribuir a disminuir el uso de anticoccidiales químicos, lo que favorece la seguridad alimentaria y un impacto ambiental mínimo de los anticoccidiales utilizados en la producción avícola.