Dentro de la familia Pseudodiaptomidae, el conjunto del género Pseudodiaptomus, que incluye especies negruzcas, presenta una distribución mundial (Walter, 1986). La mayoría se encuentra en estuarios de la región neotropical. En el litoral brasileño, dos especies (Pseudodiaptomus acutus y Pseudodiaptomus richardi) se distribuyen ampliamente de norte a sur, constituyendo material importante para diversos estudios (Tundisi y MatsumuraTundisi, 1968; Cipolli y Carvalho, 1973; Prado-Por y Lansac-Toha, 1984; Magalhães et al., 2006). Sin embargo, la especie Pseudodiaptomus gracilis ha sido registrada en agua dulce por varios autores. Según Wright (1936), la especie se distribuye ampliamente en la región del Bajo Amazonas. Fue registrada por Dahl en 1894 en agua dulce en la desembocadura del río Tocantins (Baia do Marajó). Wright, en 1928, basándose en la colección de Merril, reportó la presencia de Pseudodiaptomus gracilis en agua dulce en el lago Arary y el río Arama, Marajó, y en un pantano al oeste de Santarém, cerca de la confluencia del Tapajós con el Amazonas. Wright (también en 1935) recolectó ejemplares en varios puntos entre tierra firme en Belém y la isla de Marajó (Rio do Pará). Dussart, en 1984, encontró la especie en Venezuela en un estanque cerca del río Orinoco en Barrancas. P. gracilis también se ha encontrado en agua salobre (Stingelin, 1904) en la isla de Marajó.