Las cromosomas de paquiteno bien extendidas son críticas para estudiar la ubicación de proteínas meióticas a lo largo de cromosomas individuales. Sin embargo, producir extensiones de calidad en especies con genomas grandes es un desafío debido al enredo de los cromosomas de paquiteno. Los protocolos existentes a menudo no logran lograr una separación adecuada de los cromosomas grandes en las extensiones. Aquí, describimos detalladamente un protocolo mejorado que garantiza la separación efectiva de los cromosomas grandes de paquiteno y demuestra su idoneidad para la inmunodetección de proteínas. Para desarrollar el protocolo, se utilizaron células madre de polen en la etapa de paquiteno medio-tardío de , una especie con un genoma y cromosomas grandes. El protocolo involucró tres pasos principales: fijación de anteras en la solución de Clark (etanol-ácido acético, 3:1), digestión en una mezcla de enzimas y aplastamiento suave en ácido acético al 45%. Se observó una señal clara de ZYP1 en todos los cromosomas separados. La alta calidad de las cromosomas de paquiteno bien extendidas obtenidas con el protocolo modificado permitió la extracción fácil de cromosomas individuales para una detección y análisis más precisos de las proteínas de interés.