Predicción funcional de las comunidades microbianas en celdas de combustible microbianas de sedimento
Autores: Kuo, Jimmy; Liu, Daniel; Lin, Chorng-Horng
Idioma: Inglés
Editor: MDPI
Año: 2023
Acceso abierto
Artículo científico
2023
Predicción funcional de las comunidades microbianas en celdas de combustible microbianas de sedimento
Categoría
Ingeniería y Tecnología
Subcategoría
Bioingeniería
Palabras clave
Células de combustible microbianas de sedimento
Predicción funcional
Comunidades microbianas
Genes 16S rRNA
Enfoques computacionales
Metabolismo energético.
Licencia
CC BY-SA – Atribución – Compartir Igual
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Citaciones: Sin citaciones
Las células de combustible microbianas (MFCs) de sedimento fueron desarrolladas en las cuales los sustratos complejos presentes en el sedimento podrían ser oxidados por microbios para la producción de electrones. En este estudio, se investigó la predicción funcional de las comunidades microbianas de suelos asociados al ánodo en MFCs de sedimento basada en genes de ARNr 16S. Se aplicaron cuatro enfoques computacionales, incluyendo BugBase, Anotación Funcional de Taxones Procariotas (FAPROTAX), la Investigación Filogenética de Comunidades por Reconstrucción de Estados No Observados (PICRUSt2) y Tax4Fun2. Un total de 67, 9, 37 y 38 características funcionales fueron estadísticamente significativas. Entre estos grupos funcionales, la función relacionada con la generación de metabolitos y energía precursora fue la única incluida en los cuatro métodos computacionales, y la suma total de la proporción fue del 93.54%. El metabolismo de cofactores, portadores y la biosíntesis de vitaminas fue incluido en los tres métodos, y la suma total de la proporción fue del 29.94%. Los resultados sugirieron que las comunidades microbianas generalmente contribuyen al metabolismo energético, o que el metabolismo de cofactores, portadores y la biosíntesis de vitaminas podría revelar el estado funcional en el ánodo de MFCs de sedimento.
Descripción
Las células de combustible microbianas (MFCs) de sedimento fueron desarrolladas en las cuales los sustratos complejos presentes en el sedimento podrían ser oxidados por microbios para la producción de electrones. En este estudio, se investigó la predicción funcional de las comunidades microbianas de suelos asociados al ánodo en MFCs de sedimento basada en genes de ARNr 16S. Se aplicaron cuatro enfoques computacionales, incluyendo BugBase, Anotación Funcional de Taxones Procariotas (FAPROTAX), la Investigación Filogenética de Comunidades por Reconstrucción de Estados No Observados (PICRUSt2) y Tax4Fun2. Un total de 67, 9, 37 y 38 características funcionales fueron estadísticamente significativas. Entre estos grupos funcionales, la función relacionada con la generación de metabolitos y energía precursora fue la única incluida en los cuatro métodos computacionales, y la suma total de la proporción fue del 93.54%. El metabolismo de cofactores, portadores y la biosíntesis de vitaminas fue incluido en los tres métodos, y la suma total de la proporción fue del 29.94%. Los resultados sugirieron que las comunidades microbianas generalmente contribuyen al metabolismo energético, o que el metabolismo de cofactores, portadores y la biosíntesis de vitaminas podría revelar el estado funcional en el ánodo de MFCs de sedimento.