Con una posible prohibición futura de la castración quirúrgica en Europa, seleccionar cerdos con una capacidad reducida para acumular compuestos de olor a macho (BT) (androstenona, indol, skatole) en sus tejidos parece ser una estrategia prometedora. Las concentraciones de compuestos BT se cuantificaron en el tejido adiposo de 1075 verracos genotipados en 29,844 SNPs. Se estimaron los valores de cría tradicionales y basados en SNP utilizando BLUP basado en pedigrí (PBLUP) y BLUP genómico (GBLUP), respectivamente. Las heredabilidades para los compuestos BT fueron moderadas (0.30-0.52). Las precisiones de GBLUP y PBLUP fueron significativamente diferentes para la androstenona (0.58 y 0.36, respectivamente), pero comparables para el indol y el skatole (~0.43 y ~0.47, respectivamente). Se identificaron varias ventanas de SNP, cada una explicando un pequeño porcentaje de la varianza de las concentraciones de compuestos BT, en un estudio de asociación del genoma completo (GWAS). Un total de 18 genes candidatos previamente asociados con BT (MX1), rasgos de reproducción (TCF21, NME5, PTGFR, KCNQ1, UMODL1) y metabolismo de grasas (CTSD, SYT8, TNNI2, CD81, EGR1, GIPC2, MIGA1, NEGR1, CCSER1, MTMR2, LPL, ERFE) fueron identificados en el análisis posterior al GWAS. El gran número de genes relacionados con el metabolismo de grasas podría explicarse por la relación entre los niveles de esteroides sexuales y la deposición de grasa y ser parcialmente atribuido a la línea de cerdo investigada, que se selecciona por la calidad del jamón y no por el crecimiento magro.