Precisión de Predicción Genómica para Rasgos de Crecimiento y Carcasa en una Población de Novillas Brangus
Autores: Peters, Sunday O.; Kzlkaya, Kadir; Sinecen, Mahmut; Mestav, Burcu; Thiruvenkadan, Aranganoor K.; Thomas, Milton G.
Idioma: Inglés
Editor: MDPI
Año: 2023
Acceso abierto
Artículo científico
2023
Precisión de Predicción Genómica para Rasgos de Crecimiento y Carcasa en una Población de Novillas Brangus
Categoría
Ciencias Agrícolas y Biológicas
Subcategoría
Zootecnia
Palabras clave
Predicción lineal mejor insesgada genómica
Métodos bayesianos
Selección genómica
Desequilibrio de ligamiento
Polimorfismos de un solo nucleótido
Heredabilidad
Licencia
CC BY-SA – Atribución – Compartir Igual
Consultas: 10
Citaciones: Sin citaciones
Las habilidades predictivas y las precisiones de la predicción lineal mejor ajustada genómica (GBLUP) y los métodos de selección genómica (GS) bayesianos (BayesA, BayesB, BayesC y Lasso) para rasgos de crecimiento (pesos al nacer, al destete y de año) y de canal (profundidad de grasa de costilla, porcentaje de grasa intramuscular y área del músculo longissimus) de importancia económica se caracterizaron al estimar la estructura de desequilibrio de ligamiento (LD) en novillas Brangus utilizando marcadores de polimorfismo de nucleótido simple (SNP). Se observaron fuertes disminuciones en el LD a medida que aumentaba la distancia entre los marcadores SNP. La aplicación de los métodos GBLUP y bayesianos para obtener el GEBV para rasgos de crecimiento y de canal dentro de agrupaciones k-means y aleatorias mostró que las estimaciones de heredabilidad de k-means y agrupaciones aleatorias eran bastante similares, pero los métodos bayesianos resultaron en estimaciones de heredabilidad más bajas, entre 0.06 y 0.21 para rasgos de crecimiento y de canal, en comparación con las estimaciones entre 0.21 y 0.35 de las metodologías GBLUP. Aunque la capacidad de predicción de los métodos GBLUP y bayesianos fue bastante similar para los rasgos de crecimiento y de canal, los métodos bayesianos sobreestimaron las precisiones del GEBV debido a las estimaciones más bajas de heredabilidad de los rasgos de crecimiento y de canal. Sin embargo, GBLUP resultó en una precisión del GEBV para rasgos de crecimiento y de canal que se asemeja a informes anteriores.
Descripción
Las habilidades predictivas y las precisiones de la predicción lineal mejor ajustada genómica (GBLUP) y los métodos de selección genómica (GS) bayesianos (BayesA, BayesB, BayesC y Lasso) para rasgos de crecimiento (pesos al nacer, al destete y de año) y de canal (profundidad de grasa de costilla, porcentaje de grasa intramuscular y área del músculo longissimus) de importancia económica se caracterizaron al estimar la estructura de desequilibrio de ligamiento (LD) en novillas Brangus utilizando marcadores de polimorfismo de nucleótido simple (SNP). Se observaron fuertes disminuciones en el LD a medida que aumentaba la distancia entre los marcadores SNP. La aplicación de los métodos GBLUP y bayesianos para obtener el GEBV para rasgos de crecimiento y de canal dentro de agrupaciones k-means y aleatorias mostró que las estimaciones de heredabilidad de k-means y agrupaciones aleatorias eran bastante similares, pero los métodos bayesianos resultaron en estimaciones de heredabilidad más bajas, entre 0.06 y 0.21 para rasgos de crecimiento y de canal, en comparación con las estimaciones entre 0.21 y 0.35 de las metodologías GBLUP. Aunque la capacidad de predicción de los métodos GBLUP y bayesianos fue bastante similar para los rasgos de crecimiento y de canal, los métodos bayesianos sobreestimaron las precisiones del GEBV debido a las estimaciones más bajas de heredabilidad de los rasgos de crecimiento y de canal. Sin embargo, GBLUP resultó en una precisión del GEBV para rasgos de crecimiento y de canal que se asemeja a informes anteriores.