Este estudio se llevó a cabo para mejorar el porcentaje de grasa en la leche de vacas lecheras cruzadas en sistemas de pequeños productores, utilizando el valor de cría estimado genómicamente (GEBV). Los datos fenotípicos se recopilaron en seis estados de India de las vacas cruzadas con diferentes niveles de herencia exótica. El análisis genético se realizó utilizando el BeadChip de 50k SNP, y la imputación mejoró la precisión de los datos genómicos, aumentando la correlación de frecuencia alélica. El análisis se llevó a cabo utilizando la versión 2.2 del software FImpute. La heredabilidad se estimó utilizando Bayes R, sugiriendo un uso cauteloso para las mejoras en la cría. El GEBV ofrece a los criadores una herramienta práctica para seleccionar vacas de alto rendimiento en grasa. Esta investigación proporciona información sobre cómo mejorar el porcentaje de grasa en la leche y las estrategias de mejora genética en sistemas lecheros de pequeños productores.