Predicción Genómica de Un Solo Paso de Rasgos de Respuesta Superovulatoria en Vacas Donantes de Raza Negra Japonesa
Autores: Zoda, Atsushi; Ogawa, Shinichiro; Kagawa, Rino; Tsukahara, Hayato; Obinata, Rui; Urakawa, Manami; Oono, Yoshio
Idioma: Inglés
Editor: MDPI
Año: 2023
Acceso abierto
Artículo científico
2023
Predicción Genómica de Un Solo Paso de Rasgos de Respuesta Superovulatoria en Vacas Donantes de Raza Negra Japonesa
Categoría
Ciencias Naturales y Subdisciplinas
Subcategoría
Biología
Palabras clave
Predicción genómica
Valores de cría
Rasgos de respuesta a superovulación
Vacas donantes de raza Black japonesa
Polimorfismos de un solo nucleótido
Mejora genética
Licencia
CC BY-SA – Atribución – Compartir Igual
Consultas: 17
Citaciones: Sin citaciones
Evaluamos el rendimiento de la predicción genética de un solo paso de los valores de cría para los rasgos de respuesta superovulatoria en vacas donantes de raza Japonesa Negra. Se recopilaron un total de 25,332 registros del número total de embriones y ovocitos (TNE) y el número de buenos embriones (NGE) por flush para 1,874 vacas donantes de raza Japonesa Negra durante 2008 y 2022. Se utilizó información de genotipo sobre 36,426 polimorfismos de un solo nucleótido (SNP) autosómicos para 575 de las 1,874 vacas. Los valores de cría se predijeron utilizando un modelo animal de repetibilidad de dos rasgos. Se utilizaron dos matrices de relación genética, una basada en información de pedigrí (matriz) y la otra considerando tanto la información de pedigrí como la información de genotipo de marcadores SNP (matriz). Las heredabilidades estimadas de TNE y NGE fueron 0.18 y 0.11, respectivamente, al usar la matriz, que fueron ligeramente más bajas que al usar la matriz (0.26 para TNE y 0.16 para NGE). Las correlaciones genéticas estimadas entre los rasgos fueron 0.61 y 0.66 al usar las matrices, respectivamente. Cuando los componentes de varianza eran los mismos en la predicción del valor de cría, la confiabilidad media fue mayor al usar la matriz que al usar la matriz. Esta ventaja parece ser más prominente para las vacas con baja confiabilidad al usar la matriz. Los resultados implican que la introducción de la predicción genética de un solo paso podría aumentar la tasa de mejora genética de los rasgos de respuesta superovulatoria, pero se deben hacer esfuerzos para mantener la diversidad genética al realizar la selección.
Descripción
Evaluamos el rendimiento de la predicción genética de un solo paso de los valores de cría para los rasgos de respuesta superovulatoria en vacas donantes de raza Japonesa Negra. Se recopilaron un total de 25,332 registros del número total de embriones y ovocitos (TNE) y el número de buenos embriones (NGE) por flush para 1,874 vacas donantes de raza Japonesa Negra durante 2008 y 2022. Se utilizó información de genotipo sobre 36,426 polimorfismos de un solo nucleótido (SNP) autosómicos para 575 de las 1,874 vacas. Los valores de cría se predijeron utilizando un modelo animal de repetibilidad de dos rasgos. Se utilizaron dos matrices de relación genética, una basada en información de pedigrí (matriz) y la otra considerando tanto la información de pedigrí como la información de genotipo de marcadores SNP (matriz). Las heredabilidades estimadas de TNE y NGE fueron 0.18 y 0.11, respectivamente, al usar la matriz, que fueron ligeramente más bajas que al usar la matriz (0.26 para TNE y 0.16 para NGE). Las correlaciones genéticas estimadas entre los rasgos fueron 0.61 y 0.66 al usar las matrices, respectivamente. Cuando los componentes de varianza eran los mismos en la predicción del valor de cría, la confiabilidad media fue mayor al usar la matriz que al usar la matriz. Esta ventaja parece ser más prominente para las vacas con baja confiabilidad al usar la matriz. Los resultados implican que la introducción de la predicción genética de un solo paso podría aumentar la tasa de mejora genética de los rasgos de respuesta superovulatoria, pero se deben hacer esfuerzos para mantener la diversidad genética al realizar la selección.