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Predicción Solo de Secuencia de Super-Enhancers en Líneas Celulares Humanas Usando Modelos de Transformadores

Autores: Kravchuk, Ekaterina V.; Ashniev, German A.; Gladkova, Marina G.; Orlov, Alexey V.; Zaitseva, Zoia G.; Malkerov, Juri A.; Orlova, Natalia N.

Idioma: Inglés

Editor: MDPI

Año: 2025

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Acceso abierto

Artículo científico
2025

Predicción Solo de Secuencia de Super-Enhancers en Líneas Celulares Humanas Usando Modelos de Transformadores


Categoría

Ciencias Naturales y Subdisciplinas

Subcategoría

Biología

Palabras clave

Modelos de transformadores
Predicción de superpotenciadores
Datos de secuencias de ADN
GENA-LM
Potenciadores
Tarea de clasificación

Licencia

CC BY-SA – Atribución – Compartir Igual

Consultas: 25

Citaciones: Sin citaciones


Descripción
Esta investigación se centra en la aplicación de modelos de transformadores avanzados para la predicción de superpotenciadores en líneas celulares humanas únicamente a partir de datos de secuencia de ADN. Al aplicar el modelo de transformador GENA-LM, se logró una diferenciación efectiva entre superpotenciadores y potenciadores en múltiples líneas celulares en comparación con las técnicas utilizadas anteriormente. El enfoque sugiere el procesamiento de secuencias sin ninguna información adicional sobre el paisaje epigenético dentro de la aplicación de un modelo ajustado para la tarea de clasificación de potenciadores/superpotenciadores.

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