Predicción Solo de Secuencia de Super-Enhancers en Líneas Celulares Humanas Usando Modelos de Transformadores
Autores: Kravchuk, Ekaterina V.; Ashniev, German A.; Gladkova, Marina G.; Orlov, Alexey V.; Zaitseva, Zoia G.; Malkerov, Juri A.; Orlova, Natalia N.
Idioma: Inglés
Editor: MDPI
Año: 2025
Acceso abierto
Artículo científico
2025
Predicción Solo de Secuencia de Super-Enhancers en Líneas Celulares Humanas Usando Modelos de Transformadores
Categoría
Ciencias Naturales y Subdisciplinas
Subcategoría
Biología
Palabras clave
Modelos de transformadores
Predicción de superpotenciadores
Datos de secuencias de ADN
GENA-LM
Potenciadores
Tarea de clasificación
Licencia
CC BY-SA – Atribución – Compartir Igual
Consultas: 25
Citaciones: Sin citaciones
Esta investigación se centra en la aplicación de modelos de transformadores avanzados para la predicción de superpotenciadores en líneas celulares humanas únicamente a partir de datos de secuencia de ADN. Al aplicar el modelo de transformador GENA-LM, se logró una diferenciación efectiva entre superpotenciadores y potenciadores en múltiples líneas celulares en comparación con las técnicas utilizadas anteriormente. El enfoque sugiere el procesamiento de secuencias sin ninguna información adicional sobre el paisaje epigenético dentro de la aplicación de un modelo ajustado para la tarea de clasificación de potenciadores/superpotenciadores.
Descripción
Esta investigación se centra en la aplicación de modelos de transformadores avanzados para la predicción de superpotenciadores en líneas celulares humanas únicamente a partir de datos de secuencia de ADN. Al aplicar el modelo de transformador GENA-LM, se logró una diferenciación efectiva entre superpotenciadores y potenciadores en múltiples líneas celulares en comparación con las técnicas utilizadas anteriormente. El enfoque sugiere el procesamiento de secuencias sin ninguna información adicional sobre el paisaje epigenético dentro de la aplicación de un modelo ajustado para la tarea de clasificación de potenciadores/superpotenciadores.