Las Posiciones Determinantes de Especificidad (SDPs, por sus siglas en inglés) son sitios de proteínas responsables de la especificidad funcional dentro de una familia de proteínas homólogas. Estas posiciones se extraen de un alineamiento de secuencias múltiples de una familia y complementan las posiciones totalmente conservadas como predictores de sitios funcionales. El análisis de SDP se utiliza de forma rutinaria para localizar estos sitios relacionados con la especificidad en familias de proteínas de interés biomédico o biotecnológico con el objetivo de mutarlos para cambiar las especificidades o diseñar nuevas. Hay muchos enfoques diferentes para detectar estas posiciones en alineamientos de secuencias múltiples. Sin embargo, los métodos existentes informan sobre las posibles posiciones de SDP pero no proporcionan ninguna pista sobre la base fisicoquímica detrás de la especificidad funcional, que debe ser inferida a posteriori mediante la inspección manual de estas posiciones en el alineamiento. En este trabajo, se presenta una nueva metodología que, simultáneamente con la detección de los SDPs, proporciona automáticamente información sobre las propiedades fisicoquímicas de los aminoácidos más relacionadas con el cambio en la especificidad. Este nuevo método se aplica a dos alineamientos de secuencias múltiples diferentes de homólogos de la proteína RasH bien estudiada que representan diferentes casos de especificidad funcional y se discuten los resultados en detalle.