Reducir las emisiones de metano (CH) en la producción de arroz de secano es un objetivo importante para muchos países asiáticos para cumplir con sus compromisos de política climática. Los enfoques de inventario nacional de gases de efecto invernadero (GEI) como el enfoque Tier-2 del Panel Intergubernamental sobre Cambio Climático (IPCC) son útiles para evaluar las emisiones a escala nacional del sector agrícola. En el arroz de secano, el manejo del agua de inundación alterna (AWD) es una técnica prometedora y bien estudiada que, como se muestra en estudios experimentales, puede reducir eficazmente las emisiones de CH. Sin embargo, hasta ahora se sabe poco sobre las tasas de emisión de GEI bajo AWD cuando la técnica está completamente controlada por los agricultores. Este estudio evalúa los flujos de CH4 y óxido nitroso (NO) bajo tratamientos de inundación continua (CF) y AWD durante siete temporadas consecutivas en campos de agricultores en un sistema de riego bombeado en Luzón Central, Filipinas. Bajo el manejo de AWD, las emisiones de CH se redujeron sustancialmente (73% en la temporada seca (DS), 21% en la temporada húmeda (WS)). En todos los tratamientos, el CH es el principal contribuyente a la emisión total de GEI y, por lo tanto, se identifica como la fuerza impulsora del potencial de calentamiento global (GWP). La contribución de las emisiones de NO al GWP fue mayor en CF que en AWD, sin embargo, solo compensaron el 15% de la disminución en las emisiones de CH y, por lo tanto, no pusieron en peligro la fuerte reducción en el GWP. El estudio demuestra la viabilidad de AWD bajo el manejo de los agricultores, así como el efecto de mitigación previsto. Como resultado de este estudio, se recomienda incentivar estrategias de difusión para mejorar la efectividad de las iniciativas de mitigación. Una comparación de las emisiones de CH individuales con las emisiones calculadas con el enfoque de inventario Tier-2 del IPCC identificó que, aunque los valores promediados mostraron un grado suficiente de precisión, las fluctuaciones para puntos de medición individuales tienen una alta variación que limita el uso del método para evaluaciones a nivel de campo.