Antecedentes: Estudios en personas sugieren que las posiciones de los electrodos de electroencefalografía (EEG) en la superficie varían entre los participantes y que la consistencia de estas posiciones depende del electrodo, la región y el examinador. El objetivo era investigar la variabilidad en las posiciones de los electrodos de EEG en relación con sus regiones corticales subyacentes (CRs) en perros utilizando un sistema de neuronavegación y evaluar el uso de dicho sistema en la colocación de electrodos, a través de un estudio con cadáveres de 22 perros. Se realizaron tomografías computarizadas y resonancias magnéticas para cada perro. Estos fueron cargados en un sistema de neuronavegación donde se anotaron las CRs deseadas. Las posiciones de los electrodos se marcaron en las cabezas, que fueron posicionadas utilizando solo una guía previamente establecida y puntos de referencia anatómicos. Usando el sistema de neuronavegación, se notaron alineaciones o desviaciones de las CRs deseadas. El cincuenta y tres por ciento de todas las posiciones de electrodos marcadas mostraron una alineación con las CRs deseadas. El treinta y tres por ciento no mostró alineación, y el catorce por ciento mostró alineación parcial. El tres por ciento se desvió hacia lóbulos corticales diferentes. La colocación a través del sistema de neuronavegación permitió una colocación de electrodos confiable y replicable y una alineación de CR. El estándar para la colocación de electrodos de EEG en perros está sujeto a una alta variabilidad. Un sistema de neuronavegación puede ayudar en colocaciones de electrodos más precisas. No se pueden evaluar con precisión giros específicos en EEG sin una colocación de electrodos controlada por imágenes.