Proporcionamos la primera caracterización (preliminar) de un gen relacionado con el sistema inmunológico (MHC-) en truchas de Albania, una zona que alberga una diversidad de salmónidos rica ecológica y genéticamente, incluyendo endemismos valiosos para la conservación. Al genotipar 36 muestras de trucha, revelamos un polimorfismo de secuencia/alélico generalmente alto y una notable distintividad (34 secuencias diferentes en total, la mayoría de las cuales eran exclusivas de un taxón o población), encontrando también señales esperadas de selección positiva histórica. Curiosamente, las muestras de trucha lacustre Belvica mostraron resultados contrastantes en comparación con otras truchas examinadas. Investigaciones adicionales proporcionarán una comprensión más profunda de los mecanismos evolutivos que dan lugar al patrón observado de diversidad de MHC-. Más allá de la genética evolutiva, nuestros resultados ofrecen información útil (específicamente sobre la diversidad genética adaptativa relacionada con el sistema inmunológico) para programas de conservación destinados a preservar la viabilidad a largo plazo de poblaciones silvestres amenazadas.