Polimorfismo, Expresión y Análisis de Estructura de un Gen Clave ARNT en Ovejas ()
Autores: Wang, Xinyue; Bao, Jingjing; Bi, Yazhen; Hu, Wenping; Zhang, Li
Idioma: Inglés
Editor: MDPI
Año: 2022
Acceso abierto
Artículo científico
2022
Polimorfismo, Expresión y Análisis de Estructura de un Gen Clave ARNT en Ovejas ()
Categoría
Ciencias Naturales y Subdisciplinas
Subcategoría
Biología
Palabras clave
Rasgos de crecimiento
Industria ovina
ARNT
Varianza genética
Loci SNP
Marcador molecular
Licencia
CC BY-SA – Atribución – Compartir Igual
Consultas: 16
Citaciones: Sin citaciones
Los rasgos de crecimiento son factores influyentes que afectan significativamente el desarrollo de la industria ovina. Un análisis proteómico previo de TMT encontró que una proteína clave en la vía de señalización HIF, ARNT, puede influir en el crecimiento y desarrollo del músculo esquelético embrionario en las ovejas. El propósito de este estudio fue comprender mejor la asociación entre los polimorfismos y los rasgos de crecimiento de las ovejas, así como la función potencial de . Se llevó a cabo un qPCR en tiempo real (qRT-PCR) de para comparar su expresión en diferentes etapas de desarrollo de los tejidos musculares y los mioblastos primarios en las ovejas Hu, merino chino y Gangba. La variación genética de se detectó utilizando el BeadChip Illumina Ovine SNP 50 K y 600 K en las poblaciones de ovejas Hu y Ujimqin, respectivamente. La secuencia CDS del gen fue clonada en las ovejas Hu utilizando tecnología PCR. Finalmente, se aplicaron métodos analíticos bioinformáticos para caracterizar los genes y sus productos proteicos hipotéticos. Los resultados de qRT-PCR mostraron que el gen se expresó significativamente en el embrión de merino chino después de 85 días de gestación (D85) (< 0.05). Además, después de que las ovejas nacieron, la expresión de fue significativa en la etapa de destete de las ovejas Hu (< 0.01). Sin embargo, no hubo diferencia en las ovejas Gangba. Además, se seleccionaron seis loci SNP utilizando 50 K y 600 K BeadChip. Encontramos una asociación significativa entre rs413597480 A > G y el peso de las ovejas Hu al destete y el grosor de grasa dorsal en las ovejas de 5 meses (< 0.05), y cuatro loci SNP (rs162298018 G > C, rs159644025 G > A, rs421351865 G > A y rs401758103 A > G) también se asociaron con rasgos de crecimiento en las ovejas Ujimqin (< 0.05). Curiosamente, encontramos que una mutación G > C en 1948 bp en la secuencia CDS clonada de las ovejas Hu era la misma mutación de locus que rs162298018 G > C identificada utilizando el BeadChip de 600 K, lo que resultó en una mutación puntual de sentido no conservador, llevando a un cambio de prolina a alanina y alterando el número de sitios de unión a ADN y proteínas, así como la alfa-hélice de la proteína ARNT. Hubo un fuerte desequilibrio de ligamiento entre rs162298018 G > C y rs159644025 G > A, y la proteína ARNT fue conservada entre la cabra, las ovejas Hu y las ovejas Texel. Y proponemos que un posible marcador molecular para el crecimiento y desarrollo en las ovejas puede ser la mutación G > C en 1948 bp en la región CDS del gen. Nuestro estudio analizó sistemáticamente la expresión, estructura y función del gen y sus proteínas codificadas en las ovejas. Esto proporciona una base para futuros estudios sobre los mecanismos regulatorios del gen.
Descripción
Los rasgos de crecimiento son factores influyentes que afectan significativamente el desarrollo de la industria ovina. Un análisis proteómico previo de TMT encontró que una proteína clave en la vía de señalización HIF, ARNT, puede influir en el crecimiento y desarrollo del músculo esquelético embrionario en las ovejas. El propósito de este estudio fue comprender mejor la asociación entre los polimorfismos y los rasgos de crecimiento de las ovejas, así como la función potencial de . Se llevó a cabo un qPCR en tiempo real (qRT-PCR) de para comparar su expresión en diferentes etapas de desarrollo de los tejidos musculares y los mioblastos primarios en las ovejas Hu, merino chino y Gangba. La variación genética de se detectó utilizando el BeadChip Illumina Ovine SNP 50 K y 600 K en las poblaciones de ovejas Hu y Ujimqin, respectivamente. La secuencia CDS del gen fue clonada en las ovejas Hu utilizando tecnología PCR. Finalmente, se aplicaron métodos analíticos bioinformáticos para caracterizar los genes y sus productos proteicos hipotéticos. Los resultados de qRT-PCR mostraron que el gen se expresó significativamente en el embrión de merino chino después de 85 días de gestación (D85) (< 0.05). Además, después de que las ovejas nacieron, la expresión de fue significativa en la etapa de destete de las ovejas Hu (< 0.01). Sin embargo, no hubo diferencia en las ovejas Gangba. Además, se seleccionaron seis loci SNP utilizando 50 K y 600 K BeadChip. Encontramos una asociación significativa entre rs413597480 A > G y el peso de las ovejas Hu al destete y el grosor de grasa dorsal en las ovejas de 5 meses (< 0.05), y cuatro loci SNP (rs162298018 G > C, rs159644025 G > A, rs421351865 G > A y rs401758103 A > G) también se asociaron con rasgos de crecimiento en las ovejas Ujimqin (< 0.05). Curiosamente, encontramos que una mutación G > C en 1948 bp en la secuencia CDS clonada de las ovejas Hu era la misma mutación de locus que rs162298018 G > C identificada utilizando el BeadChip de 600 K, lo que resultó en una mutación puntual de sentido no conservador, llevando a un cambio de prolina a alanina y alterando el número de sitios de unión a ADN y proteínas, así como la alfa-hélice de la proteína ARNT. Hubo un fuerte desequilibrio de ligamiento entre rs162298018 G > C y rs159644025 G > A, y la proteína ARNT fue conservada entre la cabra, las ovejas Hu y las ovejas Texel. Y proponemos que un posible marcador molecular para el crecimiento y desarrollo en las ovejas puede ser la mutación G > C en 1948 bp en la región CDS del gen. Nuestro estudio analizó sistemáticamente la expresión, estructura y función del gen y sus proteínas codificadas en las ovejas. Esto proporciona una base para futuros estudios sobre los mecanismos regulatorios del gen.