El género es un taxón de difícil delimitación que tiene varias especies y ecotipos debido a su amplia heterogeneidad, su extrema diversidad fenotípica y la presencia de formas intermedias vinculadas a fenómenos de hibridación. El territorio siciliano alberga numerosas poblaciones silvestres y cultivadas de dos spp. L. y Duhamel, que son ecológica y morfológicamente distintas. El alcaparrón tiene un considerable interés y valor económico por sus propiedades medicinales, usos culinarios y características de cultivo. Es uno de los alimentos con mayor contenido de quercetina. La quercetina es un flavonol con propiedades antioxidantes, antiinflamatorias e inmunoestimulantes. Recientemente, patentes y estudios clínicos han destacado el efecto inhibidor de este compuesto contra varias enzimas del SARS-CoV-2 (MPro, PLPro y RdRp). Por lo tanto, el objetivo de este estudio fue cuantificar la cantidad de quercetina en y mediante LC-ESI/QTrap/MS/MS y correlacionarla con las características pedoclimáticas. Los resultados obtenidos mostraron que la quercetina es más abundante en que en . Los valores más altos de quercetina se registraron en flores, hojas y botones florales de islas volcánicas con exposiciones cálidas al suroeste y al este. En conclusión, los datos adquiridos pueden proporcionar una buena base para futuras investigaciones científicas que apoyen la identificación de posibles ecotipos como fuente de quercetina para fines alimentarios o farmacéuticos.