La arquitectura empresarial (EA) es útil para estructurar de manera efectiva las plataformas digitales con la transformación digital en las sociedades de información. Además, las plataformas digitales en la industria de la salud aceleran y aumentan la eficiencia de los procesos de descubrimiento y desarrollo de medicamentos. Sin embargo, existe una falta de conocimiento sobre las relaciones entre la EA y las plataformas digitales, a pesar de la necesidad de ello. En este documento, investigamos y analizamos el proceso de diseño y desarrollo de medicamentos dentro de la industria de la salud, junto con trabajos relacionados en el uso de un marco de arquitectura empresarial para la era digital llamado el Marco de Arquitectura Digital Integrada Adaptativa (AIDAF), que apoya específicamente el diseño de plataformas digitales allí. Basado en este análisis, evaluamos un método y proponemos una nueva arquitectura de referencia para promover plataformas digitales en la industria de la salud, con aspectos específicos futuros de las mismas que hagan un uso efectivo de la Inteligencia Artificial (IA). Las contribuciones prácticas y teóricas incluyen: (1) Procesos simplificados a través de plataformas digitales en las organizaciones. (2) Suministro y compartición de conocimiento informal entre los miembros de la organización a través de plataformas digitales. (3) Eficiencia y efectividad en la planificación de la producción y los negocios para el desarrollo de medicamentos. Los hallazgos indican que la EA con plataformas digitales utilizando el AIDAF contribuye a la transformación digital con efectividad para nuevos medicamentos en la industria de la salud.