El hongo dimórfico es el agente causal de la enfermedad de rizado de las hojas de durazno, que afecta las hojas, flores y frutos. Se empleó un enfoque de secuenciación de ARN para obtener información sobre la reprogramación transcripcional de un cultivar de durazno durante la inoculación de hojas con la fase de levadura del hongo en una interacción compatible. Los resultados revelaron modulaciones de genes diferencialmente expresados (DEGs) específicos en los duraznos y vías relacionadas con la inducción de respuestas de defensa del huésped o la colonización del patógeno y la propagación de la enfermedad. Se demostró que los perfiles de expresión de los DEGs eran altamente dependientes del tiempo y estaban relacionados con la presencia de las dos formas del crecimiento fúngico, la forma de levadura inoculada y la fase biótrofa posterior durante el desarrollo micelial. En paralelo, esta reprogramación diferencial fue consistente con una detección dipásica de la carga fúngica en las hojas desafiadas durante el período de 120 horas después de la inoculación (HAI). Las respuestas de defensa de las hojas ocurrieron durante la inoculación temprana de la fase de levadura a las 24 HAI, mediadas principalmente por procesos de modificación de la pared celular, o de manera más pronunciada durante la fase biótrofa a las 72 HAI, como lo reveló la activación de DEGs relacionados con la percepción del patógeno, la transducción de señales y el metabolismo secundario para restringir la proliferación adicional de hifas. Por el contrario, los patrones de expresión de DEGs específicos a las 120 HAI podrían contribuir aún más a la susceptibilidad del huésped. Estos hallazgos nos permitirán además elucidar las respuestas moleculares más allá de la interacción durazno-patógeno.