Peroxidasas de Clase III en el Durazno (): Identificación a Nivel Genómico y Análisis Funcional
Autores: Vodiasova, Ekaterina; Meger, Yakov; Uppe, Victoria; Tsiupka, Valentina; Chelebieva, Elina; Smykov, Anatoly
Idioma: Inglés
Editor: MDPI
Año: 2024
Acceso abierto
Artículo científico
2024
Peroxidasas de Clase III en el Durazno (): Identificación a Nivel Genómico y Análisis Funcional
Categoría
Ciencias Agrícolas y Biológicas
Subcategoría
Botánica
Palabras clave
Peroxidasas
Genes
Expresión
Estrés
Desarrollo
Tolerancia
Licencia
CC BY-SA – Atribución – Compartir Igual
Consultas: 9
Citaciones: Sin citaciones
Las peroxidasas de la Clase III son específicas de las plantas y desempeñan un papel clave en la respuesta a estrés biótico y abiótico, así como en el crecimiento y desarrollo de las plantas. En este estudio, investigamos 60 genes basados en datos genómicos y transcriptómicos disponibles en NCBI y analizamos la expresión de genes individuales con qPCR. Los genes de peroxidasa se agruparon en cinco subgrupos utilizando el análisis filogenético. Se analizó su estructura de exones e intrones y los motivos conservados. El análisis de los datos transcriptómicos mostró que la expresión de los genes variaba significativamente en diferentes tejidos, en diferentes etapas de desarrollo y bajo diferentes tratamientos de estrés. Todos los genes se dividieron en genes de baja y alta expresión, y se identificaron los genes más altamente expresados para tejidos individuales (y en yemas florales y, , y en frutos). Se reveló la relación entre la tolerancia al frío y el nivel de expresión de peroxidasa. Estos estudios se llevaron a cabo por primera vez en el durazno y confirmaron que la tolerancia al frío puede estar relacionada con la especificidad de la expresión del gen del complejo antioxidante.
Descripción
Las peroxidasas de la Clase III son específicas de las plantas y desempeñan un papel clave en la respuesta a estrés biótico y abiótico, así como en el crecimiento y desarrollo de las plantas. En este estudio, investigamos 60 genes basados en datos genómicos y transcriptómicos disponibles en NCBI y analizamos la expresión de genes individuales con qPCR. Los genes de peroxidasa se agruparon en cinco subgrupos utilizando el análisis filogenético. Se analizó su estructura de exones e intrones y los motivos conservados. El análisis de los datos transcriptómicos mostró que la expresión de los genes variaba significativamente en diferentes tejidos, en diferentes etapas de desarrollo y bajo diferentes tratamientos de estrés. Todos los genes se dividieron en genes de baja y alta expresión, y se identificaron los genes más altamente expresados para tejidos individuales (y en yemas florales y, , y en frutos). Se reveló la relación entre la tolerancia al frío y el nivel de expresión de peroxidasa. Estos estudios se llevaron a cabo por primera vez en el durazno y confirmaron que la tolerancia al frío puede estar relacionada con la especificidad de la expresión del gen del complejo antioxidante.