Perfiles de Expresión Génica Asociados con la Radio-Responsividad en Cáncer Rectal Localmente Avanzado
Autores: Lee, Jeeyong; Kwon, Junhye; Kim, DaYeon; Park, Misun; Kim, KwangSeok; Bae, InHwa; Kim, Hyunkyung; Kong, JoonSeog; Kim, Younjoo; Shin, UiSup; Kim, EunJu
Idioma: Inglés
Editor: MDPI
Año: 2021
Acceso abierto
Artículo científico
2021
Perfiles de Expresión Génica Asociados con la Radio-Responsividad en Cáncer Rectal Localmente Avanzado
Categoría
Ciencias Naturales y Subdisciplinas
Subcategoría
Biología
Palabras clave
Genes
Radioresistencia
Vías
Organoides
Metilación
Pronóstico
Licencia
CC BY-SA – Atribución – Compartir Igual
Consultas: 16
Citaciones: Sin citaciones
Los pacientes con LARC fueron clasificados según su radio-responsividad y se establecieron organoides derivados de pacientes a partir de los respectivos tejidos cancerosos. Se obtuvieron perfiles de expresión para cada grupo utilizando RNA-seq. Se utilizaron enfoques de análisis biológico y bioinformático para descifrar los genes y vías que participan en la radio-resistencia de LARC. Se identificaron treinta genes candidatos que codifican proteínas involucradas en vías relacionadas con la radio-responsividad, incluyendo el sistema inmunológico, la reparación del ADN y el control del ciclo celular. Curiosamente, uno de los genes candidatos, la catepsina E, mostró una metilación diferencial en la región del promotor que estaba inversamente correlacionada con la radio-resistencia de los organoides derivados de pacientes, lo que sugiere que el estado de metilación podría contribuir a la radio-responsividad. Con base en estos resultados, planeamos desarrollar un chip genético para diagnosticar la radio-responsividad de los pacientes con LARC, con la esperanza de que nuestros esfuerzos mejoren en última instancia el pronóstico de los pacientes con LARC.
Descripción
Los pacientes con LARC fueron clasificados según su radio-responsividad y se establecieron organoides derivados de pacientes a partir de los respectivos tejidos cancerosos. Se obtuvieron perfiles de expresión para cada grupo utilizando RNA-seq. Se utilizaron enfoques de análisis biológico y bioinformático para descifrar los genes y vías que participan en la radio-resistencia de LARC. Se identificaron treinta genes candidatos que codifican proteínas involucradas en vías relacionadas con la radio-responsividad, incluyendo el sistema inmunológico, la reparación del ADN y el control del ciclo celular. Curiosamente, uno de los genes candidatos, la catepsina E, mostró una metilación diferencial en la región del promotor que estaba inversamente correlacionada con la radio-resistencia de los organoides derivados de pacientes, lo que sugiere que el estado de metilación podría contribuir a la radio-responsividad. Con base en estos resultados, planeamos desarrollar un chip genético para diagnosticar la radio-responsividad de los pacientes con LARC, con la esperanza de que nuestros esfuerzos mejoren en última instancia el pronóstico de los pacientes con LARC.