La gestión adecuada de los organismos acuáticos es crucial, incluyendo la protección de especies endémicas y el control de especies invasoras. Desde la perspectiva de la economía circular, el uso sostenible de especies acuáticas como fuente de moléculas bioactivas es un área que se está explorando cada vez más. Esto incluye el uso de porciones no comestibles de mariscos, que podrían representar riesgos considerables para el medio ambiente debido a los métodos actuales de eliminación. Por lo tanto, es de suma importancia asegurar que la explotación de estos recursos no resulte en la transferencia de contaminantes al producto final. Este estudio analizó dos tipos de partes no comestibles del cangrejo de río: la porción abdominal del exoesqueleto (AbE) y el exoesqueleto completo (WE), incluyendo el cefalotórax. Estas porciones podrían potencialmente ser utilizadas en el contexto de actividades de erradicación reguladas por las autoridades locales. Se realizó un análisis de cribado de cuatro clases de contaminantes, incluyendo pesticidas, sustancias per- y polifluoroalquiladas (PFAS), ésteres de ácido ftálico (PAEs) y elementos traza (TEs). Los únicos analitos detectados fueron TEs, y se encontraron diferencias significativas en el perfil de contaminación entre AbE y WE. Sin embargo, los niveles registrados fueron comparables o inferiores a los reportados en la literatura y por debajo de los niveles máximos permitidos en la legislación europea actual para alimentos, lo que sugiere que su uso potencial está legalmente permitido. En términos de escalabilidad, la utilización de toda la porción no comestible representaría una solución sostenible para la reutilización de productos de desecho.