En un estudio de prueba de concepto destinado a mostrar que los metabolitos en trigo panadero (L. ssp.), los exudados del floema tienen potencial como marcadores bioquímicos para la discriminación de cultivares, cultivares argentinos de tres grupos de calidad (grupos 1, 2 y 3 de alta, intermedia y baja calidad, respectivamente) se cultivaron bajo dos disponibilidades de nitrógeno (N) y se analizaron para el perfil metabólico mediante espectrometría de masas de ionización por electrospray. Los datos como las intensidades de señal de valores de masa/carga bineados a una resolución de 0,2 Daltons fueron sometidos a análisis de componentes principales y análisis discriminante de proyecciones ortogonales a estructuras latentes. Ciertos bines fueron influyentes en la discriminación de grupos tomados en pares y algunos estuvieron involucrados en la separación de los tres grupos. En disponibilidad de N alta, los cultivares del grupo 3 se agruparon lejos de los otros cultivares, mientras que los del grupo 1 se agruparon estrechamente juntos; los cultivares del grupo 2 estaban más dispersos entre los del grupo 1 y del grupo 3. En disponibilidad de N baja, los cultivares no se agruparon tan estrechamente; sin embargo, los cultivares del grupo 1 tendieron a agruparse juntos y principalmente se separaron de los del grupo 2. Los valores de masa/carga también mostraron potencial para la discriminación entre la disponibilidad de N. En conclusión, los perfiles metabólicos de los exudados del floema podrían proporcionar marcadores bioquímicos para la selección durante la cría y para discernir los efectos de la aplicación de fertilizantes de N.