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Identificación, caracterización y perfil de expresión de la familia de genes GATA de maíz en respuesta a estrés abiótico y biótico

Autores: Hu, Yuchao; Huang, Jingyi; Yu, Li; Wang, Changjin; Zhang, Xinwei; Cheng, Xinxin; Yu, Haibing; Zhang, Kaijing

Idioma: Inglés

Editor: MDPI

Año: 2023

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Acceso abierto

Artículo científico
2023

Identificación, caracterización y perfil de expresión de la familia de genes GATA de maíz en respuesta a estrés abiótico y biótico


Categoría

Ciencias Agrícolas y Biológicas

Subcategoría

Agronomía y Ciencia de los Cultivos

Palabras clave

Factor de transcripción
Maíz
Genes GATA
Patrones de expresión
Estrés abiótico
Estrés biótico

Licencia

CC BY-SA – Atribución – Compartir Igual

Consultas: 28

Citaciones: Sin citaciones


Descripción
El factor de transcripción GATA es crucial para el crecimiento y desarrollo de las plantas, el metabolismo fisiológico y la respuesta ambiental, lo cual ha sido reportado en muchas plantas. Aunque la identificación de los genes GATA de maíz ha sido reportada previamente, el número de genes GATA de maíz era incompleto y los patrones de expresión de los genes GATA de maíz no fueron analizados. Por lo tanto, en este estudio, la familia de genes GATA de maíz (L.) fue analizada sistemáticamente. Se identificaron cuarenta y un genes de la familia GATA en el maíz y se dividieron en cuatro grupos. La estructura génica de cada subgrupo fue básicamente consistente con la del motivo. Los genes GATA de maíz estaban distribuidos en 10 cromosomas, incluyendo 3 y 17 pares de genes de duplicación en tándem y segmentaria, respectivamente. Catorce tipos de elementos -actuantes fueron identificados en las secuencias promotoras de los genes de la familia GATA de maíz, involucrando cuatro categorías: respuesta a la luz, estrés, hormonas, y crecimiento y desarrollo. El análisis de expresión específica de tejido de los genes de la familia GATA de maíz reveló que 4 genes GATA estaban altamente expresados en casi todos los tejidos de maíz, y 11 genes GATA no estaban expresados en casi todos los tejidos. Los otros genes de la familia GATA de maíz mostraron un patrón de expresión específico del tejido. Los resultados de la reanálisis de RNA-seq de datos grandes de secuenciación de transcriptoma disponibles públicamente revelaron que el gen fue significativamente regulado a la baja en respuesta a estreses abióticos incluyendo alta temperatura, baja temperatura, sequía, anegamiento y sal, y significativamente regulado al alza en respuesta a estreses bióticos incluyendo enfermedad de carbón, infección por el virus del mosaico iraní del maíz, gusano cogollero y infestaciones de pulgones. Esto indicó que el gen juega un papel importante en el crecimiento y desarrollo del maíz. Nuestros hallazgos ofrecen nuevas perspectivas sobre el papel potencial de los factores de transcripción GATA en estreses abióticos y bióticos y proporcionan una base teórica para los mecanismos moleculares subyacentes a la adaptación del maíz a tales estreses.

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