Evaluación del perfil de ARN largo no codificante muscular durante la fase de crianza y engorde de toros sometidos a diferentes estrategias nutricionales prenatales
Autores: Cracco, Roberta Cavalcante; Alexandre, Pamela Almeida; Polizel, Guilherme Henrique Gebim; Fernandes, Arícia Christofaro; de Almeida Santana, Miguel Henrique
Idioma: Inglés
Editor: MDPI
Año: 2024
Acceso abierto
Artículo científico
2024
Evaluación del perfil de ARN largo no codificante muscular durante la fase de crianza y engorde de toros sometidos a diferentes estrategias nutricionales prenatales
Categoría
Ciencias Agrícolas y Biológicas
Subcategoría
Zootecnia
Palabras clave
Nutrición materna
Vida fetal
Mecanismos epigenéticos
ARN largo no codificante
Suplementación prenatal
Expresión diferencial
Licencia
CC BY-SA – Atribución – Compartir Igual
Consultas: 8
Citaciones: Sin citaciones
La nutrición materna tiene la capacidad de influir en procesos críticos en la vida fetal, incluido el desarrollo muscular. Además, en este período, la sensibilidad epigenética a estímulos externos es mayor y produce efectos duraderos. Así, el objetivo de este estudio fue investigar los mecanismos epigenéticos, incluida la identificación y caracterización de ARN no codificantes largos (lncRNA) de animales que habían seguido diferentes estrategias de suplementación prenatal. Un grupo de vacas Nellore (n = 126) se separó en tres planes nutricionales: NP (control)-No Programado, sin suplementación proteico-energética; PP-Parcialmente Programado, suplementación proteico-energética en el último tercio del embarazo; y CP-Programación Completa, suplementación proteico-energética durante todo el período de gestación. Se utilizaron un total de 63 crías machos en este estudio, de las cuales 15 (5 por tratamiento) tenían músculo a los 15 (biopsia) y 22 meses (sacrificio). Las muestras de biopsia fueron sometidas a extracción de ARN y secuenciación. Se realizó la expresión diferencial (DE) de factores de remodelación y genes de enzimas modificadoras de la cromatina. Para la identificación y caracterización de lncRNA, se realizaron una serie de filtros de tamaño y pruebas de potencial de codificación de proteínas. Los lncRNA identificados tuvieron su expresión diferencial y potencial regulador evaluados. En cuanto a la DE de los mecanismos epigenéticos, no se encontró ningún gen expresado diferencialmente (> 0.1). La identificación de lncRNA potencial fue exitosa, identificando 1823 transcritos a los 15 meses y 1533 a los 22 meses. Entre estos, cuatro fueron considerados expresados diferencialmente entre tratamientos a los 15 meses y 6 fueron expresados diferencialmente a los 22 meses. Sin embargo, al probar el potencial regulador, 13 lncRNA fueron considerados reguladores clave en el grupo PP, y 17 en el grupo CP. Los lncRNA del grupo PP posiblemente regulan la diferenciación de células adiposas, el desarrollo embrionario in útero y el receptor del factor de crecimiento transformante beta, mientras que el lncRNA en el grupo CP regula el desarrollo embrionario in útero, la diferenciación de células adiposas y la vasculogénesis. La nutrición materna no tuvo efecto en la expresión diferencial de los mecanismos epigenéticos; sin embargo, parece afectar la regulación de lncRNA de la epigenética.
Descripción
La nutrición materna tiene la capacidad de influir en procesos críticos en la vida fetal, incluido el desarrollo muscular. Además, en este período, la sensibilidad epigenética a estímulos externos es mayor y produce efectos duraderos. Así, el objetivo de este estudio fue investigar los mecanismos epigenéticos, incluida la identificación y caracterización de ARN no codificantes largos (lncRNA) de animales que habían seguido diferentes estrategias de suplementación prenatal. Un grupo de vacas Nellore (n = 126) se separó en tres planes nutricionales: NP (control)-No Programado, sin suplementación proteico-energética; PP-Parcialmente Programado, suplementación proteico-energética en el último tercio del embarazo; y CP-Programación Completa, suplementación proteico-energética durante todo el período de gestación. Se utilizaron un total de 63 crías machos en este estudio, de las cuales 15 (5 por tratamiento) tenían músculo a los 15 (biopsia) y 22 meses (sacrificio). Las muestras de biopsia fueron sometidas a extracción de ARN y secuenciación. Se realizó la expresión diferencial (DE) de factores de remodelación y genes de enzimas modificadoras de la cromatina. Para la identificación y caracterización de lncRNA, se realizaron una serie de filtros de tamaño y pruebas de potencial de codificación de proteínas. Los lncRNA identificados tuvieron su expresión diferencial y potencial regulador evaluados. En cuanto a la DE de los mecanismos epigenéticos, no se encontró ningún gen expresado diferencialmente (> 0.1). La identificación de lncRNA potencial fue exitosa, identificando 1823 transcritos a los 15 meses y 1533 a los 22 meses. Entre estos, cuatro fueron considerados expresados diferencialmente entre tratamientos a los 15 meses y 6 fueron expresados diferencialmente a los 22 meses. Sin embargo, al probar el potencial regulador, 13 lncRNA fueron considerados reguladores clave en el grupo PP, y 17 en el grupo CP. Los lncRNA del grupo PP posiblemente regulan la diferenciación de células adiposas, el desarrollo embrionario in útero y el receptor del factor de crecimiento transformante beta, mientras que el lncRNA en el grupo CP regula el desarrollo embrionario in útero, la diferenciación de células adiposas y la vasculogénesis. La nutrición materna no tuvo efecto en la expresión diferencial de los mecanismos epigenéticos; sin embargo, parece afectar la regulación de lncRNA de la epigenética.