La tortuga estrella india es un animal comercializado masivamente en el sur de Asia. Para mitigar este riesgo, las agencias de conservación recomendaron directrices para salvaguardar esta carismática especie en la naturaleza. Adoptamos una investigación basada en ADN mitocondrial y realizamos un modelado de distribución de especies a lo largo de su rango de distribución en el subcontinente indio. Los análisis genéticos revelaron interpolaciones débiles de la forma del paisaje genético, bajas distancias intraespecíficas (0% a 1.5%) con diversidad de haplotipos mixta, y una única unidad taxonómica operativa molecular (MOTU) en el conjunto de datos del gen citocromo b. La tortuga estrella y su especie hermana mostraron un agrupamiento monofilético en la filogenia bayesiana (BA). También intentamos entender la idoneidad y calidad del hábitat en su rango de distribución. Nuestros resultados sugieren que, del área existente, solo 56,495 km (9.90%) son adecuados para esta especie, con regiones de mayor idoneidad en Sri Lanka. La estimación comparativa de la calidad del hábitat sugiere que la complejidad de la forma de los parches y la fragmentación del hábitat son mayores en los rangos occidental y sur de India, que han sido muy influenciados por un aumento en el nivel de urbanización y prácticas agrícolas. También hemos proporcionado una retrospectiva sobre la amenaza potencial relacionada con el comercio de vida silvestre en el espectro regional e internacional. Nuestros resultados detectaron múltiples centros y cruces de comercio dentro de los rangos adecuados que necesitan atención especial en la vecindad. El presente estudio llama a una estrategia de conservación adecuada para combatir la distribución fragmentada y recomienda explícitamente un cribado genético intensivo de individuos fundadores o colonias adultas aisladas, implementando reproducción científica y posterior liberación en la naturaleza para restaurar la diversidad genética perdida de las tortugas estrella.