Los péptidos de defensa del huésped (HDP) están emergiendo como fitosanitarios prometedores debido a su potencia, baja toxicidad para plantas, animales y el medio ambiente, y sobre todo, baja inducción de resistencia antimicrobiana. Estos compuestos naturales, que han sido utilizados por animales y plantas durante millones de años para defenderse contra patógenos, están siendo descubiertos mediante la minería genómica y luego producidos utilizando biofábricas. Además, se han desarrollado péptidos truncados u modificados de otra manera, incluyendo los ultra cortos, para mejorar sus bioactividades y biodistribución, y también para reducir los costos de producción. La combinación sinérgica de HDP y otros antimicrobianos, y el desarrollo de moléculas híbridas también han dado resultados prometedores. Finalmente, aunque su baja inducción de resistencia antimicrobiana es una gran ventaja, se discutieron medidas de precaución para el uso sostenible de los HDP, como el uso de herramientas de agricultura de precisión.