logo móvil
Contáctanos

Análisis in silico de péptidos de abeja melífera como posibles inhibidores de la ARN polimerasa dirigida por ADN del capripoxvirus

Autores: Mustafa, Ghulam; Mahrosh, Hafiza Salaha; Salman, Mahwish; Ali, Muhammad; Arif, Rawaba; Ahmed, Sibtain; Ebaid, Hossam

Idioma: Inglés

Editor: MDPI

Año: 2023

Descargar PDF

Acceso abierto

Artículo científico
2023

Análisis in silico de péptidos de abeja melífera como posibles inhibidores de la ARN polimerasa dirigida por ADN del capripoxvirus


Categoría

Ciencias Agrícolas y Biológicas

Subcategoría

Zootecnia

Palabras clave

Género
Capripoxvirus
Familia Poxviridae
Viruela ovina
Viruela caprina
Virus de la enfermedad de la piel nodular

Licencia

CC BY-SA – Atribución – Compartir Igual

Consultas: 10

Citaciones: Sin citaciones


Descripción
El género Capripoxvirus pertenece a la familia Poxviridae. Los virus de la viruela ovina, viruela caprina y enfermedad de la piel nodular son tres especies de este género con un 96% de identidad en sus genomas. Estas son infecciones virales devastadoras desde el punto de vista financiero entre el ganado, que causan una reducción en los productos animales y conducen a pérdidas en las industrias ganaderas. En el estudio actual, se llevó a cabo un análisis filogenético para revelar las relaciones evolutivas de las especies de Capripoxvirus (es decir, el virus de la viruela ovina (SPPV), el virus de la viruela caprina (GTPV) y el virus de la enfermedad de la piel nodular (LSDV)) con otros virus de la familia Poxviridae con más del 96% de cobertura de consulta para encontrar el índice de similitud entre todos los miembros. Los tres virus (es decir, SPPV, GTPV y LSDV) se unieron al clado de Capripoxvirus de la familia Poxviridae en el árbol filogenético y exhibieron relaciones evolutivas cercanas. La alineación de secuencias múltiples utilizando ClustalOmega reveló variaciones significativas en las secuencias de proteínas de la ARN polimerasa dependiente de ADN de SPPV, GTPV y LSDV. Las estructuras tridimensionales de cinco péptidos seleccionados de abeja y la ARN polimerasa dirigida por ADN de SPPV, GTPV y LSDV fueron predichas utilizando trRosetta e I-TASSER y se utilizaron para estudios de acoplamiento molecular y simulación. El acoplamiento proteína-proteína se llevó a cabo utilizando el servidor HADDOCK para explorar la actividad antiviral de los péptidos como proteínas de abeja contra SPPV, GTPV y LSDV. En total, cinco péptidos fueron acoplados a la ARN polimerasa dirigida por ADN de estos virus. Los péptidos melitina y secapina-1 mostraron los puntajes de unión más bajos (-106.9 +/- 7.2 kcal/mol y -101.4 +/- 11.3 kcal/mol, respectivamente) y los mejores patrones con complejos estables. La simulación de dinámica molecular indicó que el complejo de la ARN polimerasa dependiente de ADN y el péptido melitina permaneció firmemente conectado y la unión del péptido a la proteína receptora fue estable. Los hallazgos de este estudio proporcionan evidencia de los péptidos de abeja como potentes agentes antimicrobianos contra los virus de la viruela ovina, viruela caprina y enfermedad de la piel nodular sin complejidad.

Otros recursos que podrían interesarte

Temas Virtualpro