Los péptidos antimicrobianos (AMPs) se han identificado en todo el metazoario, lo que sugiere su naturaleza evolutivamente conservada, y su presencia en los teleósteos no es una excepción. Los AMPs son péptidos cortos (18-46 aminoácidos), generalmente catiónicos y anfipáticos. Aunque los AMPs son diversos en secuencia de aminoácidos, sin que haya dos AMPs idénticos, colectivamente parecen tener funciones conservadas en la inmunidad innata de los animales frente a los patógenos que encuentran en su entorno. Los AMPs de los peces se regulan al alza en respuesta a patógenos y parecen tener una actividad antimicrobiana de amplio espectro tanto hacia patógenos humanos como de peces. Sin embargo, ha surgido un papel emergente para los AMPs como moléculas inmunomoduladoras: la capacidad de los AMPs para activar el sistema inmunológico innato arroja luz sobre la capacidad multifacética de estos pequeños péptidos para combatir patógenos a través de medios directos e indirectos. En este sentido, esta revisión se centra en el papel de los AMPs de teleósteos como moduladores del sistema inmunológico innato y su regulación en respuesta a patógenos u otras moléculas exógenas. La capacidad de regular la expresión de AMPs por factores exógenos puede resultar útil para modular la expresión de AMPs en peces para prevenir enfermedades, particularmente en entornos de acuicultura donde las condiciones de hacinamiento y el estrés ambiental predisponen a estos peces a infecciones.