Las mitocondrias, orgánulos clave en la producción de energía, dependen críticamente de los genes codificados por mitocondrias. Este estudio comparó sistemáticamente el marco de lectura abierto mitocondrial aviar de las secuencias de codificación/proteínas del 12S rRNA-c (MOTS-c) y realizó un análisis filogenético. Las secuencias de MOTS-c aviar exhiben una alta similitud pero contienen una eliminación de nucleótidos clave en comparación con los mamíferos, lo que resulta en aminoácidos divergentes en la parte posterior. El MOTS-c de pollo se expresa de manera ubicua, con los niveles más altos en el corazón, y se reduce significativamente por el ayuno. La integración de RNA-seq y ensayos moleculares reveló que el péptido MOTS-c de pollo modula la vía de señalización AKT. Estos hallazgos establecen una base para explorar péptidos derivados de mitocondrias en aves y para informar sobre la cría genética de aves de corral mitocondriales.