La podredumbre de la raíz es una de las enfermedades más graves transmitidas por el suelo en cultivos de crucíferas en todo el mundo. El tratamiento de semillas con agentes de biocontrol es una forma efectiva y ecológica de controlar la enfermedad de la podredumbre de la raíz. Sin embargo, existe un gran desafío para inocular la semilla con células bacterianas a través del pelleteado de semillas debido al entorno hostil en la superficie de la semilla o en la rizosfera. En este estudio, se desarrolló un método para el pelleteado microbiano de semillas para proteger las plántulas de pak choi contra la enfermedad de la podredumbre de la raíz. Típicamente, una bacteria de biocontrol, ZF129, fue encapsulada mediante el método de secado por pulverización con goma arábiga como material de pared, y luego las semillas de pak choi fueron pelleteadas con el ZF129 microencapsulado (ZF129m). Se evaluaron la morfología, la estabilidad de almacenamiento y el comportamiento de liberación de las microcápsulas de ZF129. En comparación con las células desnudas de ZF129, las células encapsuladas de ZF129 mostraron una mayor viabilidad durante el almacenamiento ambiental en semillas de pak choi. Además, las semillas pelleteadas de ZF129m mostraron una mayor eficacia de control (71.23%) contra la enfermedad de la podredumbre de la raíz que las semillas pelleteadas de ZF129 no encapsuladas (61.64%) en pak choi. El pelleteado de semillas con el biocontrol microencapsulado ZF129 demostró ser una estrategia efectiva y ecológica para el control de la enfermedad de la podredumbre de la raíz en pak choi.