Aplicación de la prueba de PCR en tiempo real TaqMan multiplex en la encuesta de cinco virus del lirio que infectan spp
Autores: Xu, Leifeng; Song, Meng; Ming, Jun
Idioma: Inglés
Editor: MDPI
Año: 2021
Acceso abierto
Artículo científico
2021
Aplicación de la prueba de PCR en tiempo real TaqMan multiplex en la encuesta de cinco virus del lirio que infectan spp
Categoría
Ciencias Agrícolas y Biológicas
Subcategoría
Agronomía y Ciencia de los Cultivos
Palabras clave
Virus
Método de detección
PCR en tiempo real TaqMan
Cebadores
Sondas
Especificidad
Licencia
CC BY-SA – Atribución – Compartir Igual
Consultas: 28
Citaciones: Sin citaciones
(LSV), (LMoV), (CMV), (SYSV) y (PlAMV) son cinco de los virus económicamente importantes que infectan a los lirios ( spp.) en todo el mundo. Para prevenir la ocurrencia y propagación de estos virus, es necesario desarrollar un método de detección rápido, efectivo y sensible para la detección simultánea y cuantificación específica de estos virus. En este estudio, se utilizaron cebadores y sondas específicos para ensayos de PCR en tiempo real multiplex TaqMan diseñados a partir de regiones conservadas de la secuencia de la proteína de la cápside de cada virus para la detección simultánea de estos virus en lirios ( spp.). La concentración óptima de cebadores y sondas y la temperatura de alineación de la reacción fueron de 20 uM y 55.9 grados C, respectivamente. Los límites de detección del ensayo fueron 1.33 x 10, 1.27 x 10, 1.28 x 10, 2.33 x 10 y 2.01 x 10 copias·L para LSV, LMoV, CMV, SYSV y PlAMV, respectivamente. La especificidad se determinó utilizando siete patógenos virales de lirios. Las pruebas de variabilidad intra e interensayos mostraron una alta reproducibilidad con coeficientes de variación.
Descripción
(LSV), (LMoV), (CMV), (SYSV) y (PlAMV) son cinco de los virus económicamente importantes que infectan a los lirios ( spp.) en todo el mundo. Para prevenir la ocurrencia y propagación de estos virus, es necesario desarrollar un método de detección rápido, efectivo y sensible para la detección simultánea y cuantificación específica de estos virus. En este estudio, se utilizaron cebadores y sondas específicos para ensayos de PCR en tiempo real multiplex TaqMan diseñados a partir de regiones conservadas de la secuencia de la proteína de la cápside de cada virus para la detección simultánea de estos virus en lirios ( spp.). La concentración óptima de cebadores y sondas y la temperatura de alineación de la reacción fueron de 20 uM y 55.9 grados C, respectivamente. Los límites de detección del ensayo fueron 1.33 x 10, 1.27 x 10, 1.28 x 10, 2.33 x 10 y 2.01 x 10 copias·L para LSV, LMoV, CMV, SYSV y PlAMV, respectivamente. La especificidad se determinó utilizando siete patógenos virales de lirios. Las pruebas de variabilidad intra e interensayos mostraron una alta reproducibilidad con coeficientes de variación.