Desarrollo de un ensayo de PCR en tiempo real multiplex para la detección simultánea de diez patógenos virales importantes del trigo
Autores: Deb, Mahua; Anderson, Joseph M.; Scofield, Steven R.
Idioma: Inglés
Editor: MDPI
Año: 2023
Acceso abierto
Artículo científico
2023
Desarrollo de un ensayo de PCR en tiempo real multiplex para la detección simultánea de diez patógenos virales importantes del trigo
Categoría
Ciencias Agrícolas y Biológicas
Subcategoría
Agronomía y Ciencia de los Cultivos
Palabras clave
Virus del mosaico del trigo
Virus de las tierras altas
ácaro del rizado amarillo del trigo
RT-PCR múltiple
Virus de la cebada y enanismo amarillo de los cereales
Electroforesis capilar
Licencia
CC BY-SA – Atribución – Compartir Igual
Consultas: 25
Citaciones: Sin citaciones
El virus del mosaico del trigo (TriMV) y el virus de las tierras altas (HPV), identificados recientemente, han sido considerados entre los principales virus que afectan al trigo. Transportados por el mismo vector, el ácaro del rizado del trigo, ambos de estos virus causan amarillamiento y enanismo de las plantas que son muy similares a muchos otros virus que atacan al trigo. Esto hace que sea difícil detectar estos virus en diferentes líneas de trigo, planteando un problema importante en el rendimiento. Este documento destaca la adición de estos dos virus a un método basado en multiplex RT-PCR que ya detectaba la presencia de los virus de la cebada y de los enanismos amarillos de los cereales (B/CYDVs), el virus del mosaico del trigo transmitido por el suelo (SBWMV), el virus del mosaico de la espiga del trigo (WSSMV) y el virus del mosaico en franjas del trigo (WSMV). El método utiliza conjuntos específicos de cebadores que detectan los virus TriMV y HPV objetivo a 560 pb y 490 pb, respectivamente, en presencia de otros virus distintos como B/CYDVs -PAV, -MAV, -SGV, -RPV, -RMV, WSSMV, SBWMV y WSMV a 295, 175, 237, 400, 365, 154, 219 y 193 pb, respectivamente. El cebador hacia adelante para cada virus específico fue etiquetado fluorescentemente para detectarlo de manera más eficiente en la electroforesis capilar. Los diez virus pueden ser vistos como picos en un electroferograma de la electroforesis capilar correspondiente a sus tamaños de producto en pares de bases. Este avance en el protocolo permite la detección de los diez virus del trigo en una sola prueba, mejorando así la capacidad de diagnóstico con solo un ligero aumento en el costo.
Descripción
El virus del mosaico del trigo (TriMV) y el virus de las tierras altas (HPV), identificados recientemente, han sido considerados entre los principales virus que afectan al trigo. Transportados por el mismo vector, el ácaro del rizado del trigo, ambos de estos virus causan amarillamiento y enanismo de las plantas que son muy similares a muchos otros virus que atacan al trigo. Esto hace que sea difícil detectar estos virus en diferentes líneas de trigo, planteando un problema importante en el rendimiento. Este documento destaca la adición de estos dos virus a un método basado en multiplex RT-PCR que ya detectaba la presencia de los virus de la cebada y de los enanismos amarillos de los cereales (B/CYDVs), el virus del mosaico del trigo transmitido por el suelo (SBWMV), el virus del mosaico de la espiga del trigo (WSSMV) y el virus del mosaico en franjas del trigo (WSMV). El método utiliza conjuntos específicos de cebadores que detectan los virus TriMV y HPV objetivo a 560 pb y 490 pb, respectivamente, en presencia de otros virus distintos como B/CYDVs -PAV, -MAV, -SGV, -RPV, -RMV, WSSMV, SBWMV y WSMV a 295, 175, 237, 400, 365, 154, 219 y 193 pb, respectivamente. El cebador hacia adelante para cada virus específico fue etiquetado fluorescentemente para detectarlo de manera más eficiente en la electroforesis capilar. Los diez virus pueden ser vistos como picos en un electroferograma de la electroforesis capilar correspondiente a sus tamaños de producto en pares de bases. Este avance en el protocolo permite la detección de los diez virus del trigo en una sola prueba, mejorando así la capacidad de diagnóstico con solo un ligero aumento en el costo.