Varios productos alimenticios, elaborados a partir de trigos descascarados, se ofrecen actualmente en el mercado, que van desde granos y pasta hasta harina y productos de panadería. La posibilidad de verificar la autenticidad de las especies de trigo utilizadas en cualquier punto de la cadena de producción es relevante, en defensa tanto de los productores como de los consumidores. Se ha desarrollado un ensayo de PCR digital en chip para detectar y cuantificar porcentajes de trigos sin cáscara (es decir, trigo común y trigo duro) y trigos con cáscara (es decir, espelta, emmer y einkorn) en granos, harinas y productos alimenticios. El ensayo se ha diseñado sobre un polimorfismo en el sitio objetivo de miRNA172 del factor de transcripción AP2-5 localizado en el cromosoma 5A y que está involucrado en la morfogénesis de la espiga de trigo y la trilla de granos. El ensayo se ha evaluado incluso en un sistema de PCR en tiempo real para evaluar su aplicabilidad y comparar los costos analíticos entre los enfoques de dPCR y PCR en tiempo real.