El carcinoma urotelial canino (UC) y el carcinoma prostático (PC) a menudo presentan desafíos diagnósticos debido a sus ubicaciones anatómicas. La mutación BRAF V595E, análoga a la mutación BRAF V600E humana, ha sido identificada en UC y PC. La PCR digital de orina es un método diagnóstico no invasivo para la detección de mutaciones, pero la disponibilidad del equipo necesario es limitada. Este estudio tuvo como objetivo desarrollar una PCR convencional para detectar la mutación BRAF V595E en orina y muestras de lavado prostático de perros con UC o PC. Se validaron cebadores específicos para detectar los genes BRAF V595E salvaje y mutante en 34 tejidos fijados en formalina y embebidos en parafina (FFPE), 116 muestras de orina y 9 muestras de lavado prostático. Los resultados mostraron que la tasa de detección de la mutación BRAF V595E para UC y PC en los tejidos fue del 51.6%. La tasa de detección en muestras líquidas de perros con masas del tracto urinario inferior o próstata fue del 53.2%. De los 41 casos con seguimiento, 16 fueron diagnosticados posteriormente con UC o PC, y el 75% de las muestras líquidas de estos perros mostraron la mutación BRAF V595E. Este método de PCR convencional proporciona una herramienta de detección confiable y no invasiva para UC y PC en perros, especialmente en entornos sin equipo avanzado.