Los caracoles cono depredadores desarrollaron un sofisticado mecanismo neurofarmacológico para capturar presas, escapar de otros depredadores y disuadir competidores. La notable especificidad de su veneno para varios canales iónicos y receptores es un logro evolutivo atribuible a la variedad de componentes peptídicos del veneno (conotoxinas). Sin embargo, lo que causó la divergencia de las conotoxinas sigue siendo incierto y puede estar relacionado con el cambio en la presa. El análisis de componentes principales reveló eventos de agrupamiento dentro de subgrupos de dieta, indicando patrones de similitud en la secuencia de péptidos basados en la presa que someten. Se realizaron análisis moleculares utilizando alineación de secuencias múltiples y análisis de elementos estructurales para observar los eventos a nivel molecular que causaron el agrupamiento. Se identificaron tres subgrupos distintos. Los resultados mostraron regiones homólogas y residuos conservados dentro de los subgrupos de dieta, pero divergentes entre otros grupos. Especificamos que estos elementos estructurales causaron el agrupamiento en las alfaconotoxinas que pueden desempeñar un papel en la especificidad funcional. En cada subgrupo de dieta, el carácter de los aminoácidos, la longitud de los aminoácidos intervinientes entre los residuos de cisteína y la longitud del polipéptido influyeron en el agrupamiento. Este estudio proporciona información molecular sobre el papel del cambio en la presa, específicamente la preferencia dietética, en la divergencia de las conotoxinas.