Los brotes de frijol mungo (L.) Wilczek son populares en todo el mundo debido a su sabor, valor nutricional, composición bioquímica bien equilibrada y otras propiedades beneficiosas para la salud humana. Las condiciones de germinación afectan la composición de metabolitos en los brotes de frijol mungo, por lo que se requiere un estudio detallado sobre su variabilidad. Este artículo presenta los resultados de una comparación de la composición de metabolitos en las hojas de los brotes de frijol mungo germinados primero en la oscuridad (DS) y luego en la luz (LS). La cromatografía de gases con espectrometría de masas (GC-MS) permitió identificar más de 100 compuestos que representan varios grupos de fitoquímicos. Los alcoholes, aminoácidos y sacáridos predominaban en la cantidad total de compuestos. El análisis de perfiles metabolómicos expuso una variabilidad intra e intervarietal bastante alta en el contenido de metabolitos. DS y LS diferían en el contenido cualitativo y cuantitativo de los compuestos identificados. La variabilidad intravarietal fue más pronunciada en DS que en LS. DS demostró niveles más altos de sacáridos, ácidos grasos, acilgliceroles y compuestos fenólicos, mientras que los aminoácidos fueron más altos en LS. Se registraron cambios en el contenido cuantitativo de metabolitos que participan en la respuesta de las plantas a estresores: ornitina, prolina, GABA, derivados del inositol, etc. Los cambios fueron probablemente inducidos por el estrés que experimentaron los brotes al ser transferidos de la sombra a la luz. El análisis de varianza y el análisis de factores principales mostraron el efecto estadísticamente significativo de las condiciones de germinación en el contenido de compuestos individuales en las hojas. Las características identificadas de la variabilidad de metabolitos en los genotipos de frijol mungo cultivados en diferentes condiciones contribuirán a una selección más precisa de un patrón de iluminación para obtener brotes con composiciones bioquímicas deseables para su uso en diversas dietas y productos con alto valor nutricional.