La interacción de las plantas con el medio ambiente afecta el metabolismo de lípidos. Se han reportado cambios en el patrón de fosfolípidos en respuesta al estrés abiótico, particularmente la acumulación de triacilgliceroles, pero se sabe menos sobre la alteración del metabolismo de lípidos en respuesta al estrés biótico y se han estudiado más intensamente las hojas que las raíces. Este trabajo investiga los niveles de lípidos en raíces así como en hojas en respuesta a patógenos y moléculas elicitoras mediante UPLC-TOF-MS. Los niveles de triacilgliceroles aumentaron en raíces y de manera sistémica en hojas tras el tratamiento de raíces con el hongo. Tras la infección por aspersión de hojas con el patógeno bacteriano, los triacilgliceroles se acumularon localmente en las hojas pero no en las raíces. El tratamiento de raíces con un elicitor de lipopolisacáridos bacterianos indujo una fuerte acumulación de triacilgliceroles en raíces y hojas. La inducción de la expresión del efector bacteriano AVRRPM1 resultó en un aumento dramático de los niveles de triacilgliceroles en hojas, lo que indica que las moléculas elicitoras son suficientes para inducir la acumulación de triacilgliceroles. Estos resultados ofrecen una visión de los cambios locales y sistémicos en el metabolismo de lípidos en raíces y hojas en respuesta a estrés biótico.