El objetivo de este estudio fue verificar una relación entre las enfermedades respiratorias y la presencia de agentes virales a través de análisis moleculares. Se inscribió una cohorte de 14 caballos durante un período de 6 meses. Todos los sujetos fueron sometidos a una evaluación clínica del tracto respiratorio y a un lavado broncoalveolar utilizado para análisis citológicos y de biología molecular. No se obtuvieron resultados positivos en los estudios moleculares realizados tanto por métodos de PCR como de NGS, excepto por una secuencia de 753 pb obtenida de una yegua pura sangre de 2 años de edad, referida por bajo rendimiento y tos esporádica al inicio de la sesión de entrenamiento. El análisis de la secuencia resultó en homología completa con cepas de Equid gammaherpesvirus 2. La implicación viral no parecía ser común en caballos con asma. La falta de detección del virus puede deberse al pequeño tamaño de la muestra de la población incluida.