El pez cebra es un hospedador natural de varias especies y un organismo modelo sustituto para la investigación de la tuberculosis. Es evolutivamente una de las especies no tuberculosas más cercanas y comparte la mayoría de los genes de virulencia. Aunque el pez cebra no es un hospedador natural del patógeno humano, hemos demostrado previamente la infección robótica exitosa de embriones de pez cebra y hemos realizado tratamiento con medicamentos en las larvas infectadas. En el presente estudio, examinamos durante cuánto tiempo se puede propagar en larvas de pez cebra y probamos una serie temporal de larvas infectadas para estudiar la respuesta transcripcional a través de la secuenciación profunda de ARN Illumina (RNAseq). Se pudieron detectar agregados bacterianos que portan etiquetas fluorescentes hasta 9 días después de la infección. Las larvas infectadas mostraron una respuesta inmune transcripcional clara y específica con una alta similitud a la respuesta inflamatoria de las larvas de pez cebra infectadas con la especie sustituta. Concluimos que se puede propagar en larvas de pez cebra durante al menos una semana después de la infección y proporcionamos más evidencia de que es un buen modelo sustituto para . Los extensos conjuntos de datos del transcriptoma generados serán de gran utilidad para añadir valor translacional al pez cebra como modelo para la infección de tuberculosis utilizando el sistema de infección. Además, identificamos nuevos genes marcadores como y CD180 que son inducidos por la infección en el pez cebra y en macrófagos humanos en etapas posteriores de la infección que pueden ser investigados más a fondo.