Las áreas afromontanas y afroalpinas constituyen algunos de los principales puntos críticos de biodiversidad de África. Son particularmente ricas en endemismos vegetales, pero los orígenes biogeográficos y los procesos evolutivos que conducen a esta destacada diversidad son poco comprendidos. Realizamos análisis filogenómicos y biogeográficos de uno de los géneros de plantas más ricos en especies de estas montañas (Compositae-Gnaphalieae). La mayoría de los estudios anteriores se han centrado en elementos afroalpinos de origen euroasiático, y el origen del sur de África proporciona un interesante contraejemplo. Obtuvimos un conjunto de datos nucleares completo de 304 especies (~50% del género) utilizando enriquecimiento por objetivos con el conjunto de sondas Compositae1061. Los enfoques de coalescencia resumida y concatenación combinados con la recuperación de parálagos produjeron filogenias congruentes y bien resueltas. Las estimaciones de rango ancestral revelaron que se originó en el árido sur de África, mientras que las praderas del sur de África fueron la fuente de la mayoría de las linajes que se dispersaron dentro y fuera de África. La colonización de las áreas afromontanas y afroalpinas tropicales ocurrió repetidamente a lo largo del Mioceno-Plioceno. Este momento coincide con el levantamiento de montañas y el inicio de ciclos glaciares, que juntos pueden haber facilitado tanto la especiación como el flujo génico intermontano, contribuyendo a la evolución de la flora afroalpina.