Los primates no humanos (NHP) albergan una variedad de parásitos helmintos y protistas que pueden causar infecciones en humanos. Se estudiaron parásitos gastrointestinales en NHP que viven en dos jardines zoológicos del norte de Italia. Se recolectaron un total de 96 muestras fecales de 26 grupos de NHP. Se aplicó el método mini-Flotac a las muestras fecales para detectar helmintiasis gastrointestinales, mientras que la detección de los protistas spp. se realizó mediante PCR anidada y PCR en tiempo real; se estudiaron más a fondo secuenciando el mismo gen para los genes de betagiardina y isomerasa de triosa fosfato (TPI). Veintidós de las 96 muestras fecales examinadas (22.9%) fueron positivas para una o más especies de helmintos, incluyendo huevos de Trichurid, Capillariid y Strongylid. Todas las muestras fueron negativas para spp., mientras que 16/26 (61.5%) de los animales fueron positivos en la PCR en tiempo real; las secuencias obtenidas las asignaron todas al sub-ensamblaje BIV. spp. se detectó en 22/26 de los NHP (84.6%); los análisis moleculares atribuyeron los aislados al ST 4, alelo 92. Los análisis de las heces de ratas simpátricas revelaron la presencia del mismo alelo, así como de huevos, lo que genera preocupación sobre su papel como reservorios de parásitos en las instalaciones.