La industria de cabras de Nueva Zelanda accede a mercados nicho para productos de alto valor, principalmente fórmula para bebés y niños pequeños. Este estudio tuvo como objetivo estimar los parámetros genéticos de ocurrencia y susceptibilidad de la cojera clínica y los trastornos de las pezuñas seleccionados, y establecer sus asociaciones genéticas con las características de producción de leche. Se recopiló información sobre pedigrí, cojera, trastornos de las pezuñas y producción de leche en tres granjas entre junio de 2019 y julio de 2020. El conjunto de datos contenía 1637 hembras de 174 machos y 1231 hembras. Se obtuvieron estimaciones de varianzas genéticas y residuales (co)varianzas, heredabilidades y correlaciones genéticas y fenotípicas con modelos animales univariados y bivariados. Los modelos incluyeron los efectos fijos de la granja y la paridad, la desviación de la fecha media de parto como covariable, y los efectos aleatorios del animal y el error residual. Las estimaciones de heredabilidad (h) para la ocurrencia y susceptibilidad de la cojera fueron 0.07 y 0.13, respectivamente. Las estimaciones de h para las susceptibilidades a los trastornos de las pezuñas variaron de 0.02 a 0.23. Las correlaciones genotípicas variaron de débiles a muy fuertes entre la cojera y las características de producción de leche (-0.94 a 0.84) y de débiles a moderadas (0.23 a 0.84) entre los trastornos de las pezuñas y las características de producción de leche.