Los pequeños ARN (sARN) son el sello distintivo y los principales efectores del silenciamiento de ARN y, por lo tanto, están involucrados en procesos biológicos importantes en las plantas, como la regulación de la expresión génica, la defensa antiviral y la integridad del genoma de las plantas. Los mecanismos de amplificación de sARN, así como su naturaleza móvil y rápida generación, sugieren que los sARN son posibles moduladores clave de la comunicación intercelular e inter-especies en las interacciones planta-patógeno-plaga. Los sARN endógenos de las plantas pueden actuar en cis para regular la inmunidad innata de la planta contra los patógenos, o en trans para silenciar los ARN mensajeros (ARNm) de los patógenos y afectar la virulencia. Asimismo, los sARN derivados de patógenos pueden actuar en cis para regular la expresión de sus propios genes y aumentar la virulencia hacia un hospedador vegetal, o en trans para silenciar los ARNm de la planta e interferir con la defensa del hospedador. En las enfermedades virales de las plantas, la infección viral altera la composición y abundancia de sARN en las células vegetales, no solo al desencadenar e interferir con la respuesta antiviral de silenciamiento de ARN de la planta, que acumula pequeños ARN interferentes derivados de virus (vsiARN), sino también al modular los sARN endógenos de la planta. Aquí, revisamos el conocimiento actual sobre la naturaleza y actividad de los sARN responsivos a virus durante las interacciones virus-planta y discutimos su papel en la modulación trans-reino de los vectores de virus en beneficio de la diseminación del virus.