El seguimiento longitudinal del ADN tumoral circulante del paciente (ctDNA) proporciona un método potente para rastrear la progresión, remisión y recurrencia de varios tipos de cáncer. Frecuentemente, enfoques clínicos e investigativos implican la revisión manual de informes individuales de biopsias líquidas después de muestreos y pruebas genómicas. Aquí describimos un proceso desarrollado para integrar técnicas utilizadas en la ciencia de datos dentro de un marco de investigación sobre cáncer. Mediante la recolección de datos, un análisis que clasifica mutaciones genéticas cancerosas como patogénicas y una metodología de emparejamiento de pacientes que identifica al mismo donante en todos los informes de biopsias líquidas, el trabajo manual para el personal de investigación se reduce drásticamente. Los paneles de control automatizados proporcionan vistas longitudinales de los datos del paciente para estudios de investigación, permitiendo investigar la progresión del tumor y la eficacia del tratamiento mediante la identificación de las frecuencias alélicas variantes de ctDNA a lo largo del tiempo.