Los procedimientos en la granja tienen un impacto en el bienestar animal al activar el eje hipotálamo-hipófiso-adrenal, lo que induce una amplia gama de respuestas fisiológicas. Este sistema adaptativo garantiza que el animal se adapte a las variaciones ambientales e induce cambios metabólicos y moleculares que pueden ser cuantificados. Los microARNs (miARNs) juegan un papel clave en la regulación de la homeostasis y la evidencia emergente ha identificado miARNs circulantes como biomarcadores prometedores de trastornos relacionados con el estrés en los animales. Basado en un análisis de agrupamiento de las tendencias y niveles de cortisol salival, 20 ovejas fueron clasificadas en dos grupos diferentes. La introducción de un carnero en el rebaño fue identificada como una práctica común en la granja y un punto de referencia para recolectar muestras de saliva. Se seleccionaron dieciséis miARNs relacionados con la respuesta de adaptación. Entre ellos, miR-16b, miR-21, miR-24, miR-26a, miR-27a, miR-99a y miR-223 fueron amplificados en muestras de saliva. El Grupo 1 se caracterizó por una menor expresión de miR-16b y miR-21 en comparación con el Grupo 2 (< 0.05). Este estudio identificó por primera vez varios miARNs expresados en la saliva de ovejas, señalando diferencias significativas en los patrones de expresión entre los grupos de cortisol. Además, los análisis de tendencias de estos miARNs resultaron en grupos (= 0.017), sugiriendo la posible cooperación de miR-16b y -21 en las respuestas integradas al estrés, como ya se ha demostrado en otras especies. Se necesita más investigación para definir el papel de estos miARNs, pero la evaluación de los miARNs salivales podría apoyar la selección de ovejas para diferentes perfiles de respuesta a fuentes de estresores comunes en el escenario de la granja.