Un método de extracción de ARN optimizado y rentable para tejidos enriquecidos en metabolitos secundarios de Picea abies (abeto noruego)
Autores: Singh, Vivek Vikram; Naseer, Aisha; Sellamuthu, Gothandapani; Jaku, Rastislav
Idioma: Inglés
Editor: MDPI
Año: 2024
Acceso abierto
Artículo científico
2024
Un método de extracción de ARN optimizado y rentable para tejidos enriquecidos en metabolitos secundarios de Picea abies (abeto noruego)
Categoría
Ciencias Agrícolas y Biológicas
Subcategoría
Botánica
Palabras clave
Desarrollo
Secuenciación de próxima generación
Extracción de ARN
Protocolo CTAB
Abeto de Noruega
Calidad del ARN
Licencia
CC BY-SA – Atribución – Compartir Igual
Consultas: 11
Citaciones: Sin citaciones
Desde el desarrollo de técnicas de secuenciación de próxima generación y con el creciente interés en estudios transcriptómicos, hay una demanda de técnicas de extracción de ARN de alto rendimiento. Los protocolos generales de extracción de ARN son poco fiables en cuanto a la calidad y cantidad de ARN aislado obtenido de diferentes tipos de tejidos de diferentes especies de plantas. A pesar de que el abeto de Noruega es una de las especies de árboles más significativas y comercialmente valiosas en los bosques europeos, solo hay una investigación genética limitada disponible. En este estudio, desarrollamos un protocolo de bromuro de cetiltrimetilamonio (CTAB) modificando el método original. Comparamos este protocolo de CTAB con otros métodos ampliamente utilizados para extraer ARN de diferentes tejidos (aguja, floema y raíz) del abeto de Noruega, conocido por su riqueza en polifenoles, polisacáridos y metabolitos secundarios. El método CTAB modificado demuestra ser superior a los métodos basados en kits y en TRIzol para extraer ARN de los tejidos ricos en metabolitos del abeto de Noruega, resultando en altos valores de calidad e integridad del ARN (RIN~7-9). El método de extracción de ARN CTAB modificado es rápido, rentable y relativamente simple para obtener la calidad de ARN deseada de los tejidos del abeto de Noruega. Es óptimo para la secuenciación de ARN y otras aplicaciones moleculares posteriores.
Descripción
Desde el desarrollo de técnicas de secuenciación de próxima generación y con el creciente interés en estudios transcriptómicos, hay una demanda de técnicas de extracción de ARN de alto rendimiento. Los protocolos generales de extracción de ARN son poco fiables en cuanto a la calidad y cantidad de ARN aislado obtenido de diferentes tipos de tejidos de diferentes especies de plantas. A pesar de que el abeto de Noruega es una de las especies de árboles más significativas y comercialmente valiosas en los bosques europeos, solo hay una investigación genética limitada disponible. En este estudio, desarrollamos un protocolo de bromuro de cetiltrimetilamonio (CTAB) modificando el método original. Comparamos este protocolo de CTAB con otros métodos ampliamente utilizados para extraer ARN de diferentes tejidos (aguja, floema y raíz) del abeto de Noruega, conocido por su riqueza en polifenoles, polisacáridos y metabolitos secundarios. El método CTAB modificado demuestra ser superior a los métodos basados en kits y en TRIzol para extraer ARN de los tejidos ricos en metabolitos del abeto de Noruega, resultando en altos valores de calidad e integridad del ARN (RIN~7-9). El método de extracción de ARN CTAB modificado es rápido, rentable y relativamente simple para obtener la calidad de ARN deseada de los tejidos del abeto de Noruega. Es óptimo para la secuenciación de ARN y otras aplicaciones moleculares posteriores.