Las condiciones limitantes de agua pueden afectar severamente el rendimiento del arroz. Por lo tanto, aumentar la tolerancia de las plantas al estrés hídrico es una prioridad para muchos programas de mejoramiento de arroz. Sin embargo, mejorar la tolerancia del arroz a este estrés abiótico conlleva varias complicaciones relacionadas con las prácticas de siembra, el sistema de gestión del agua adoptado y la etapa de crecimiento en la que ocurre el estrés hídrico. Por esta razón, es un desafío esbozar ideotipos individuales que muestren rasgos adecuados para superar la sequía en diferentes momentos durante el ciclo de vida del arroz en diversos ecosistemas de cultivo. El conocimiento actual de la genómica y los compuestos bioquímicos puede contribuir a la creación de ideotipos de arroz flexibles hacia diversas condiciones de disponibilidad de agua. Se demostró que los rasgos identificados en accesiones del ancestro silvestre del arroz cultivado, así como en otras especies de arroz silvestre y arroz invasor, confieren una mayor tolerancia al estrés hídrico, mientras que los análisis de germoplasmas de arroz cultivado identificaron varios genes/loci que mejoran la resistencia al estrés hídrico. Nuevas fronteras están representadas por la disección del control epigenético de la tolerancia al estrés y la implementación de la contribución de microbiota favorable. Las tecnologías de mejoramiento innovadoras, cuya viabilidad está relacionada con los avances en los análisis genómicos, están contribuyendo a mejorar el desarrollo basado en el conocimiento de variedades de arroz tolerantes al estrés hídrico.