El establecimiento de áreas de conservación se considera uno de los enfoques más efectivos para abordar la pérdida de biodiversidad con recursos limitados. La identificación de puntos críticos de diversidad de plantas y brechas de conservación ha desempeñado un papel crucial en la optimización de las áreas de conservación. La utilización de diversos tipos de datos de investigación puede mejorar eficazmente el reconocimiento de puntos críticos y brechas de conservación. La diversidad de rasgos fenotípicos es una biogeografía funcional que analiza los patrones de distribución geográfica, la formación y las razones para el desarrollo de rasgos fenotípicos específicos o múltiples de los organismos. El color de las flores y el color de los frutos son rasgos fenotípicos primarios a través de los cuales las plantas interactúan con otros organismos, afectando su propia supervivencia y reproducción, así como la de su descendencia. Este estudio utilizó datos de 1923 Especies de Diversidad de Rasgos Fenotípicos (PTDS) con características de color de flores y frutos para optimizar las áreas de conservación en las Montañas Qinling de Shaanxi. Además, se utilizaron datos de 1838 especies endémicas (ES), 190 especies amenazadas (TS) y 119 especies protegidas (PS) para la validación. Los datos se obtuvieron principalmente del Catálogo de Plantas Vasculares en Shaanxi, complementados por el Herbario Virtual Chino y el Herbario Digital de Shaanxi. Los resultados revelan que al comparar los límites de las áreas de conservación existentes con los determinados por cuatro tipos de datos, se encuentran brechas de conservación en 14 condados en las Montañas Qinling de Shaanxi. El área de conservación existente solo representa el 13.3% del área determinada por los cuatro tipos de datos. Existen brechas en la conservación de la biodiversidad en las Montañas Qinling de Shaanxi, y el uso macroscópico de los datos de rasgos fenotípicos de plantas contribuye a optimizar estas brechas de conservación.