Actualmente, los sistemas de producción de vegetales han sido modificados para mejorar el rendimiento y la calidad, lo que ha llevado a una mejora en la sostenibilidad. En el cultivo hortícola, uno de los sectores más importantes es la producción de plántulas en viveros. En el pasado, las plántulas hortícolas eran producidas directamente por los agricultores. Hoy en día, los viveros industrializados proporcionan plántulas caracterizadas por un crecimiento uniforme y un desarrollo temprano y contemporáneo. Además, la preocupación del consumidor sobre el impacto de la producción de alimentos en el medio ambiente está impulsando una mayor demanda de vegetales orgánicos con un consecuente aumento de la tierra agrícola cultivada mediante métodos orgánicos. Por lo tanto, existe la necesidad de producir plántulas de alta calidad adecuadas para ser cultivadas en el sistema de agricultura orgánica. La gestión de la zona de raíces, para mejorar la calidad de las plántulas de cultivos hortícolas orgánicos, sigue siendo en gran parte inexplorada, por lo que esta revisión destaca algunas de las investigaciones actuales y las prioridades de desarrollo futuro, proporcionando información útil a los productores de viveros. En particular, revisamos todo el conocimiento científico y moderno sobre la producción de plántulas orgánicas, saludables y vigorosas, incluyendo el uso de: (1) compost y té de compost; (2) subproductos agroindustriales; (3) bioestimulantes vegetales microbianos y no microbianos; (4) microorganismos beneficiosos.